Система здравоохранения Эстонии основана на медицинском страховании, исходящем из принципа обязательной солидарности, а также общей доступности услуг, предлагаемых частно-правовыми производителеми медицинских услуг. Управление системой здравоохранения и надзор над ней, а также разработка политики в отношении здоровья является задачей Министерства социальных дел, а также управляемых им учреждений.

Основные органы, ответственные за планирование, управление, регулирование и финансирование функций системы здравоохранения учреждения – Министерство социальных дел и такие находящиеся в его ведомстве учреждения, как Департамент лекарственных средств и Департамент здоровья, а также независимое частно-правовое учреждение Больничная касса Эстонии. Относящиеся к собственности публичного сектора больницы и частно-правовые медицинские учреждения первого уровня, а также некоторые неправительственные организации и профессиональные объединения являются частью сложной организационной структуры системы здравоохранения.

Посредством Министерства социальных дел и находящихся в его ведомстве учреждений государство несет ответственность за общую политику в области здоровья, в том числе, за развитие и внедрение стратегий в отношении здоровья народонаселения, а также за надзор за качеством и доступностью медицинских услуг. Основной задачей министерства является правовое регулирование сферы здоровья. Министерство социальных дел было создано в 1993 году путем объединения трех отдельных министерств (Министерство здравоохранения, Министерство социального обеспечения и Министерство по вопросам труда). Исходя из этого, министерство ведет свою деятельность в трех основных политических сферах: здоровье, социальные услуги и трудовая занятость. В сфере здоровья к числу основных задач Министерства социальных дел относится разработка политики в области здоровья, мониторинг состояния здоровья населения, а также организация государственной здравоохранительной системы посредством общей и специальной врачебной помощи, а также определения пределов здоровья населения. 

Деятельность Министерства социальных дел в области здравоохранения координирует действия Департамента Здоровья, Департамента лекарственных средств и Института развития здоровья, хотя все эти учреждения несут непосредственную ответственность перед министром.

К числу основных задач Департамента здоровья  относятся выдача лицензий производителям медицинских услуг, регистрация медицинских работников, контроль качества медицинских услуг, а также финансирование и организация услуг скорой помощи.

Департамент лекарственных средств несет ответственность за то, чтобы применяемые в Эстонии лекарственные препараты были эффективными, качественными и безопасными, а также использовались целесообразно, и при их ввозе/вывозе и торговле ими соблюдаются согласованные правила. Под надзором Департамента лекарственных средств находятся проводимые в Эстонии клинические исследования лекарственных препаратов, а также используемые при лечении людей клетки, ткани и органы.

Институт развития здоровья несет ответственность за прикладную научную деятельность и анализ в сферах здоровья народонаселения, окружающей среды и инфекционных заболеваний, а также занимается мониторингом состояния здоровья населения и представлением данных.

Основная роль Больничной кассы – быть активным покупателем медицинских услуг, в обязанности которого входит заключение договоров с производителями медицинских услуг, оплата медицинских услуг, возмещение расходов на лекарственные препараты, а также оплата расходов на временную нетрудоспособность и возмещения по беременности и родам.

Кроме того, стратегическую роль в сфере здравоохранения играет Министерство финансов, управляющее финансированием здравоохранения посредством государственного бюджета. Министерство юстиции несет ответственность за оказание и финансирование стационарной и амбулаторной помощи заключенным. Министерство внутренних дел организует контроль здоровья в арестных домах лицам, находящимся под постоянным наблюдением, но необязательно являющимся заключенными.

Министерство обороны управляет системой медицинских услуг, предназначенной для амбулаторного лечения работников министерства во время прохождения ими воинской службы. Стационарное лечения осуществляется в гражданских больницах. Военнослужащие имеют обязательное медицинское страхование во время службы в армии, но все расходы на медицинские услуги и лекарственные препараты покрываются из государственного бюджета.

В Эстонии оказание медицинских услуг почти полностью децентрализовано. Медицинские услуги могут оказывать лица и учреждения, ведущие свою деятельность в качестве частно-правовых юридических лиц: коммерческого объединения, целевого фонда или предпринимателя-физического лица. Большинство больниц находятся в собственности органов местного самоуправления акционерными обществами или основаны государством, органами местного самоуправлениями или прочими частно-правовыми организациями целевыми фондами. Коммерческие объединения, оказывающие помощь семейных врачей, могут предлагать только общую медицинскую помощь и услуги сестринской помощи. 
Основные предписания и инициативы по предотвращению убытков, связанных со здравоохранением, основываются на Законе об организации оказания медицинских услуг и Законе об обязательственном праве. В системе здравоохранения Эстонии не ведется систематической регистрации медицинских ошибок, однако Больничная кассa проводит регулярные клинические аудиты медицинских услуг в различных медицинских учреждениях. В случае ошибок при лечении прозводитель медицинских услуги должен возместить пациенту моральный и материальный ущерб, возникший в ходе оказания медицинской услуги.

Рынок лекарственных средств в Эстонии строго регулируется. Существует порядок отчетности в случае побочных эффектов напрямую Департаменту лекарственных средств.

В перечне медицинских услуг всего перечислено более 2 000 различных медицинских услуг. В случае специальной медицинской помощи к числу способов оплаты относятся, прежде всего оплата на основе услуги, койко-дня и на основании диагноза. В случае амбулаторного лечения основным способом оплаты является оплата на основании услуги (лабораторные исследования, радиология и др.), а в случае стационарной медицинской помощи применяется комбинация способов оплаты на основании услуги, койко-дня и диагноза. Система здравоохранения Эстонии основана на медицинском страховании, исходящем из принципа обязательной солидарности, а также общей доступности услуг, предлагаемых частно-правовыми производителеми медицинских услуг. Управление системой здравоохранения и надзор над ней, а также разработка политики в отношении здоровья является задачей Министерства социальных дел, а также управляемых им учреждений.

Основные органы, ответственные за планирование, управление, регулирование и финансирование функций системы здравоохранения учреждения – Министерство социальных дел и такие находящиеся в его ведомстве учреждения, как Департамент лекарственных средств и Департамент здоровья, а также независимое частно-правовое учреждение Больничная касса Эстонии. Относящиеся к собственности публичного сектора больницы и частно-правовые медицинские учреждения первого уровня, а также некоторые неправительственные организации и профессиональные объединения являются частью сложной организационной структуры системы здравоохранения.

Посредством Министерства социальных дел и находящихся в его ведомстве учреждений государство несет ответственность за общую политику в области здоровья, в том числе, за развитие и внедрение стратегий в отношении здоровья народонаселения, а также за надзор за качеством и доступностью медицинских услуг. Основной задачей министерства является правовое регулирование сферы здоровья. Министерство социальных дел было создано в 1993 году путем объединения трех отдельных министерств (Министерство здравоохранения, Министерство социального обеспечения и Министерство по вопросам труда). Исходя из этого, министерство ведет свою деятельность в трех основных политических сферах: здоровье, социальные услуги и трудовая занятость. В сфере здоровья к числу основных задач Министерства социальных дел относится разработка политики в области здоровья, мониторинг состояния здоровья населения, а также организация государственной здравоохранительной системы посредством общей и специальной врачебной помощи, а также определения пределов здоровья населения. 

Деятельность Министерства социальных дел в области здравоохранения координирует действия Департамента Здоровья, Департамента лекарственных средств и Института развития здоровья, хотя все эти учреждения несут непосредственную ответственность перед министром.

К числу основных задач Департамента здоровья  относятся выдача лицензий производителям медицинских услуг, регистрация медицинских работников, контроль качества медицинских услуг, а также финансирование и организация услуг скорой помощи.

Департамент лекарственных средств несет ответственность за то, чтобы применяемые в Эстонии лекарственные препараты были эффективными, качественными и безопасными, а также использовались целесообразно, и при их ввозе/вывозе и торговле ими соблюдаются согласованные правила. Под надзором Департамента лекарственных средств находятся проводимые в Эстонии клинические исследования лекарственных препаратов, а также используемые при лечении людей клетки, ткани и органы.

Институт развития здоровья несет ответственность за прикладную научную деятельность и анализ в сферах здоровья народонаселения, окружающей среды и инфекционных заболеваний, а также занимается мониторингом состояния здоровья населения и представлением данных.

 
Основная роль Больничной кассы – быть активным покупателем медицинских услуг, в обязанности которого входит заключение договоров с производителями медицинских услуг, оплата медицинских услуг, возмещение расходов на лекарственные препараты, а также оплата расходов на временную нетрудоспособность и возмещения по беременности и родам.

Кроме того, стратегическую роль в сфере здравоохранения играет Министерство финансов, управляющее финансированием здравоохранения посредством государственного бюджета. Министерство юстиции несет ответственность за оказание и финансирование стационарной и амбулаторной помощи заключенным. Министерство внутренних дел организует контроль здоровья в арестных домах лицам, находящимся под постоянным наблюдением, но необязательно являющимся заключенными.

Министерство обороны управляет системой медицинских услуг, предназначенной для амбулаторного лечения работников министерства во время прохождения ими воинской службы. Стационарное лечения осуществляется в гражданских больницах. Военнослужащие имеют обязательное медицинское страхование во время службы в армии, но все расходы на медицинские услуги и лекарственные препараты покрываются из государственного бюджета.

В Эстонии оказание медицинских услуг почти полностью децентрализовано. Медицинские услуги могут оказывать лица и учреждения, ведущие свою деятельность в качестве частно-правовых юридических лиц: коммерческого объединения, целевого фонда или предпринимателя-физического лица. Большинство больниц находятся в собственности органов местного самоуправления акционерными обществами или основаны государством, органами местного самоуправлениями или прочими частно-правовыми организациями целевыми фондами. Коммерческие объединения, оказывающие помощь семейных врачей, могут предлагать только общую медицинскую помощь и услуги сестринской помощи. 
Основные предписания и инициативы по предотвращению убытков, связанных со здравоохранением, основываются на Законе об организации оказания медицинских услуг и Законе об обязательственном праве. В системе здравоохранения Эстонии не ведется систематической регистрации медицинских ошибок, однако Больничная кассa проводит регулярные клинические аудиты медицинских услуг в различных медицинских учреждениях. В случае ошибок при лечении прозводитель медицинских услуги должен возместить пациенту моральный и материальный ущерб, возникший в ходе оказания медицинской услуги.

Рынок лекарственных средств в Эстонии строго регулируется. Существует порядок отчетности в случае побочных эффектов напрямую Департаменту лекарственных средств.

В перечне медицинских услуг всего перечислено более 2 000 различных медицинских услуг. В случае специальной медицинской помощи к числу способов оплаты относятся, прежде всего оплата на основе услуги, койко-дня и на основании диагноза. В случае амбулаторного лечения основным способом оплаты является оплата на основании услуги (лабораторные исследования, радиология и др.), а в случае стационарной медицинской помощи применяется комбинация способов оплаты на основании услуги, койко-дня и диагноза.